ওয়ারফারিন একটি ভিটামিন কে প্রতিপক্ষী। এটি ভিটামিন কে এপক্সাইড রিডাক্টেজ এনজাইমকে বাধা দিয়ে কাজ করে, যা শরীরে ভিটামিন কে পুনঃচক্রীকরণের জন্য অপরিহার্য। ভিটামিন কে-এর সক্রিয় রূপ একটি কোফ্যাক্টর হিসেবে কাজ করে যা জমাট বাঁধার উপাদান (ক্লটিং ফ্যাক্টর) II (থ্রম্বিন), VII, IX এবং X-এর γ-কার্বক্সিলেশন (সক্রিয়করণ) সক্ষম করে। এই কার্বক্সিলেশন প্রক্রিয়া ফ্যাক্টরগুলিকে ক্যালসিয়াম এবং ফসফোলিপিড পৃষ্ঠের সাথে আবদ্ধ হতে দেয়, যা রক্ত জমাট বাঁধার জন্য প্রয়োজনীয়। এই পরিবর্তন ছাড়া, এই জমাট বাঁধার উপাদানগুলি নিষ্ক্রিয় থাকে এবং রক্ত জমাট বাঁধার প্রক্রিয়া বাধাগ্রস্ত হয়। প্রাকৃতিক অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট প্রোটিন সি এবং সেও সঠিকভাবে কাজ করার জন্য এই প্রক্রিয়ার প্রয়োজন।কার্বক্সিলেশন বিক্রিয়ার সময়, সক্রিয় ভিটামিন কে ভিটামিন কে এপক্সাইডে রূপান্তরিত হয়। সাধারণত, ভিটামিন কে এপক্সাইড রিডাক্টেজ এনজাইম এই এপক্সাইডকে পুনরায় সক্রিয় আকারে ফিরিয়ে আনে। ওয়ারফারিন এই এনজাইমকে অবরুদ্ধ করে, পুনঃচক্রীকরণ প্রক্রিয়া বন্ধ করে দেয়। ফলে, শরীরে সক্রিয় ভিটামিন কে-এর ঘাটতি হয় এবং নিষ্ক্রিয় জমাট বাঁধার উপাদান তৈরি হয়। ওয়ারফারিন থেরাপি শুরুর সময়, সাময়িকভাবে হাইপারকোয়াগুলেবল (রক্ত জমাট বাঁধার ঝুঁকি বেড়ে যাওয়া) অবস্থা দেখা দিতে পারে, কারণ প্রাকৃতিক অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট প্রোটিন সি এবং এস কিছু জমাট বাঁধার উপাদানের তুলনায় দ্রুত ভেঙে যায়। প্রোটিন সি এবং এস-এর অর্ধায়ু কম (যথাক্রমে ৮ এবং ২৪ ঘন্টা), এবং ফ্যাক্টর VII-এর অর্ধায়ুও খুব কম (৬ ঘন্টা)। কিন্তু ফ্যাক্টর IX, X এবং থ্রম্বিন অনেক ধীরে ভাঙে, যাদের অর্ধায়ু যথাক্রমে ২৪, ৩৬ এবং ৫০ ঘন্টা। এর অর্থ হল, পুরো অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট প্রভাব কার্যকর হওয়ার আগে, কিছু সময়ের জন্য শরীরে অধিকাংশ জমাট বাঁধার উপাদান উপস্থিত থাকা সত্ত্বেও ক্লট প্রতিরোধকারী উপাদানগুলোর অভাব থাকে। ওয়ারফারিনের প্রভাব বিপরীতমুখী করতে, ভিটামিন কে সরবরাহ করতে হবে (খাদ্য, সাপ্লিমেন্টের মাধ্যমে, অথবা শরীরকে পুনরায় উৎপাদনের সুযোগ দিয়ে) যাতে যকৃত নতুন, কার্যকরী জমাট বাঁধার উপাদান তৈরি করতে পারে। এই প্রক্রিয়ায় সাধারণত প্রায় দুই দিন সময় লাগে। এছাড়াও, ভিটামিন কে₂ (যা কার্যকরীভাবে ভিটামিন কে₁-এর মতো) অন্ত্রের ব্যাকটেরিয়া দ্বারা উৎপাদিত হয়। এই কারণেই অ্যান্টিবায়োটিক ওয়ারফারিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে পারে; তারা এই ব্যাকটেরিয়াগুলিকে মেরে ফেলতে পারে, ফলে ভিটামিন কে-এর মাত্রা কমে যায় এবং ওয়ারফারিনের প্রভাব বেড়ে যেতে পারে।