অধিকাংশ পার্শ্বপ্রতিক্রিয়া ওষুধের মিনারালোকোর্টিকয়েড প্রভাবের সাথে সম্পর্কিত, বিশেষ করে সোডিয়াম এবং পানি ধরে রাখার কারণে। এর মধ্যে থাকতে পারে এরিথিমা (ত্বকের লালচে ভাব), পাপুরা (চামড়ায় রক্তক্ষরণ), মাথা ঘোরা, প্যানক্রিয়াটাইটিস, চোখের ভেতরের চাপ বৃদ্ধি, পেশীর দুর্বলতা, উচ্চ রক্তচাপ, অঙের ফোলা, হৃদয় বড় হওয়া, কংজেসটিভ হার্ট ফেইলিওর, স্টেরয়েড মায়োপ্যাথি, পেপটিক আলসার, অস্টিওপোরোসিস, কাঁপুনি, মাসিক অনিয়ম, পটাসিয়াম হ্রাস, হাইপোক্যালেমিক অ্যালকালোসিস, এবং অ্যালার্জিক বা অ্যানাফাইল্যাকটিক প্রতিক্রিয়া। যখন ফ্লুড্রোকোর্টিসোন প্রস্তাবিত কম ডোজে দেওয়া হয়, তখন পার্শ্বপ্রতিক্রিয়া সাধারণত কম ঘটে। তবে, বিশেষ করে দীর্ঘমেয়াদি চিকিৎসায় বা কর্টিসোন বা অন্যান্য গ্লুকোকোর্টিকয়েডের সাথে একত্রে ব্যবহার করলে উপরের উল্লেখিত পার্শ্বপ্রতিক্রিয়াগুলো বিবেচনা করা উচিত।